Conocer cómo es el tiempo en Isla Fernandina te ayudará a disfrutar tu estadía al máximo. Por lo general, los meses más cálidos son marzo y febrero, con una temperatura promedio de 26 °C, mientras que los meses más fríos son septiembre y octubre, con un promedio de 22 °C. El promedio de precipitaciones anuales en Isla Fernandina es de 319 mm.