La mejor zona para alojarse en Merowe suele ser el centro de la ciudad o a lo largo de las orillas del Nilo, ofreciendo un cómodo acceso a los servicios locales y a los sitios históricos.
El centro de la ciudad de Merowe es el centro principal para los visitantes. Es donde encontrará la mayoría de las tiendas locales, pequeños restaurantes y casas de huéspedes. La zona es bastante compacta, lo que facilita la navegación a pie. A menudo se encontrará cerca del mercado local, que ofrece una visión de la vida cotidiana.
Para aquellos interesados en la exploración histórica, alojarse más cerca de los sitios arqueológicos de la antigua ciudad de Napata, particularmente alrededor de las pirámides de Nuri o Jebel Barkal, es ideal. Aunque las opciones de alojamiento aquí pueden estar más limitadas a lodges o casas de huéspedes patrimoniales específicos, ofrecen un acceso inigualable a estas magníficas estructuras antiguas.